Séquençage haut débit et écologie microbienne

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Chimie / Bio

Process et métiers des laboratoires

Intra-entreprise

Distanciel

Présentiel

Français

Objectifs

Comprendre le séquençage génomique à haut débit.
Être capable de choisir la technologie adaptée à son projet.
Connaître les outils bio-informatiques utilisés.
Connaître les analyses statistiques possibles.

Prérequis :

Bases de biologie moléculaire et PCR

Moyens pédagogiques et d’encadrement :

Séances avec le formateur, Support pédagogiques format numérique, alternance entre théorique et pratique, cas concrets

Dispositif de suivi et d’évaluation des acquis :

Mise en pratique et exercices, Appréciation de la formation à chaud.

Résultats & compétences attendus à l’issue de la formation :

À l’issue de cette formation, le participant sera en mesure de déterminer comprendre le séquençage génomique à haut débit, de solliciter les technologies et outils bio-informatiques appropriés et d’effectuer les analyses statistiques potentielles.

Programme de la formation

Méthodes moléculaires
- Séquençage HTS.
- Métagénomique ciblée.
- Métagénomique globale.
- Analyses RNA-seq.
- CRISPR/Cas9.
Applications en écologie microbienne
- Extraction d’ADN microbien.
- Analyse bioinformatique des séquences.
- L’analyse de données : diversité, cluster, réseau, core-microbiome

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Durée

7 heures

Niveau

Débutant

Public

Scientifiques souhaitant acquérir les concepts théoriques et les applications du séquençage haut débit en écologie microbienne.

Participants

8 personnes maximum

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