Séquençage haut débit et écologie microbienne

Chimie / Bio
Process et métiers des laboratoires
Intra-entreprise
Présentiel
Distanciel
Français

Objectifs

  • Comprendre le séquençage génomique à haut débit.
  • Être capable de choisir la technologie adaptée à son projet.
  • Connaître les outils bio-informatiques utilisés.
  • Connaître les analyses statistiques possibles.

Prérequis :

  • Bases de biologie moléculaire et PCR

Moyens pédagogiques et d’encadrement :

  • Séances avec le formateur, Support pédagogiques format numérique, alternance entre théorique et pratique, cas concrets

Dispositif de suivi et d’évaluation des acquis :

  • Mise en pratique et exercices, Appréciation de la formation à chaud.

Résultats & compétences attendus à l’issue de la formation :

  • À l’issue de cette formation, le participant sera en mesure de déterminer comprendre le séquençage génomique à haut débit, de solliciter les technologies et outils bio-informatiques appropriés et d’effectuer les analyses statistiques potentielles.

Programme de la formation

  1. Méthodes moléculaires
    • Séquençage HTS.
    • Métagénomique ciblée.
    • Métagénomique globale.
    • Analyses RNA-seq.
    • CRISPR/Cas9.
  2. Applications en écologie microbienne
    • Extraction d’ADN microbien.
    • Analyse bioinformatique des séquences.
    • L’analyse de données : diversité, cluster, réseau, core-microbiome
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Durée
7 heures
Niveau
Débutant
Public
Scientifiques souhaitant acquérir les concepts théoriques et les applications du séquençage haut débit en écologie microbienne.
Participants
8 personnes maximum
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